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基础概念>数据流
EnviFusion的图层之间具有顺序流动关系，一般的图层链接逻辑是：输入——>工具变换——>输出。下面对这三个环节逐一介绍。
输入
数据主要通过两种途径进入EnviFusion：文件输入和内置数据体输入。每个EnviFusion工程可以导入多个数据体，这些数据体各自作为一个图层，为其后的变换工具提供原始数据。
外部文件
目前EnviFusion支持的输入文件类型包括：
ASCII编码类文本文件：后缀如csv，txt，dat，xyz等。这些文件应具有完整的表格结构，一般要求第一行为表头，其它行为数据。分隔符一般应为逗号、空格、或Tab键，若有特殊分隔符应在读取文件时做相应说明。
带有时间标记的文本文件（csvt后缀）：这是EnviFusion的内置文件格式，与csv文件类似，即以逗号分隔的表格文件。但要求数据中必须有一列为数值类的时间字段，用来标识数据体的时间特征。
EnviFusion数据文件（efd后缀）：这是EnviFusion的内置文件格式，用来保存当前图层中的所有空间类数据。每个efd文件一般对应一个同时生成的数据文件夹，以.data结尾。如果用户修改了此文件夹，将会造成不可逆的数据损失。
EnviFusion工程文件（efp后缀）：这是EnviFusion的内置文件格式，用来保存当前内存中的整个工程。
GIS矢量文件：常见的空间地理矢量文件，如ArcMap的shp文件、AutoCAD的dxf文件、Adobe的pdf文件等。由于第三方软件更新迭代较快，若此类文件读取中出现错误，可以考虑将数据转换为更为基础的文件类型，如txt类型。
GIS栅格文件：常见的图像文件和空间地理栅格文件，如ArcMap的adf文件、带有高程信息的tiff文件、Golden Software的grd文件、bmp/jpg/png图像文件等。
GMS地下水模拟文件：GroundWater Modeling System（GMS）是主流的地下水水流溶质运移模拟界面，其工程文件一般附带h5数据文件，用户可尝试使用EnviFusion对此类h5数据文件进行读取。
ModFlow2000/2005模型输出文件：ModFlow是主流的地下水流模拟引擎，其输出文件包含了空间各处的水头数据，入口文件后缀一般为nam、mfn、in等。由于各厂家自行生成的ModFlow变种较多，请用户仔细尝试，确定适合自己的文件入口。
MT3DMS模型输出文件：MT3DMS是主流的地下水溶质运移模拟引擎，其输出文件包含了空间各处的溶质浓度信息，入口文件后缀一般为cnf。
数字高程文件（dem）：dem文件格式是美国地调局（USGS）开发的数字高程模型文件。
内置数据体
除外部文件外，EnviFusion也可以根据内置算法生成一些标准数据体，如散点、线段、均匀网格等。具体请参见标准数据源章节。
工具变换
进入EnviFusion中的数据体可以经过各类变换生成新的图层。接受变换的图层称为输入图层，执行结果称为输出图层。一般情况下，一个输入图层对应一个输出图层。但有些变换工具需要两个输入图层来产生一个输出图层（如散点采样工具需要一个数据源图层和一个采样点图层），而另一些工具将从一个输入图层生成两个输出图层（如主成分分析工具会产生一个协方差矩阵图层和一个降维结果图层）。EnviFusion中的工具操作请参见工具箱章节。
输出
EnviFusion的输出模式有渲染窗口输出、表格窗口输出、图表窗口输出、文件输出四类。以下逐一介绍。
渲染窗口
EnviFusion中的渲染窗口有如下几类：
3D渲染窗口：一般3D渲染窗口，用于大多数图层渲染场景。如下图所示：
3D渲染快照：以阵列形式嵌入多个3D渲染窗口，同时提供接口用于按顺序改变图层属性，达到对比效果。如下图所示：
表格窗口
表格窗口用于以只读形式查看图层的后台数据，包括全部四类数据结构（散点数据、网格数据、向量数据、表格数据）。由于数据流由图层间关系严格确定，所以EnviFusion不提供后台手工修改原始数据的接口。用户可以改变数据的显示设置和排序设置。如下图所示：
图表窗口
EnviFusion中的图表窗口有如下几类：折线图、散点图、柱状图、直方图。用来针对图层中的属性数据进行直观表示。
折线图样式
散点图样式
柱状图样式
直方图样式
文件输出
EnviFusion中的文件输出途径有如下几类：工程文件、图层文件、表格文件、截图文件、动画文件。以下逐一进行介绍。
工程文件：用来保存当前项目内存中的全部信息。对于数据源文件，工程文件并不进行复制，而是保存工程与文件间的链接，如果这些输入数据源文件发生变化，可能导致工程无法正常打开。对工程文件的操作通过文件菜单中的“保存EnviFusion工程”和“打开EnviFusion工程”来进行。
图层文件：用来保存当前高亮图层中的全部数据信息，如果当前图层包含多个时间步，系统会提示用户选择仅保存当前时间步，还是保存本图层的所有时间步。对图层文件的操作通过通用工具条中的“打开”和“保存”按钮来进行。
表格文件：用来保存当前图层的当前数据结构（散点数据、网格数据、向量数据、表格数据之一）中的原始数据。对表格文件的操作通过表格视图中的“导出表格”按钮来进行。
截图文件：用来保存当前渲染窗口中的图片截图。对截图文件的操作通过3D渲染视图中的“截屏到剪切板或文件”按钮来进行。
动画文件：用来保存当前渲染窗口中的时间动画。对动画文件的操作通过文件菜单中的“保存动画”菜单来进行。